Uno de los principales aliados de la FENAMM es el Gobierno federal a través de las dependencias prioritarias para el desarrollo local. Con esta alianza se busca facilitar el proceso de desarrollo de los Municipios, al realizar gestiones que permitan la canalización de fondos, el financiamiento y apoyo económico para proyectos específicos de los Ayuntamientos; con especial enfoque en los temas estructurales municipalistas, hacendarios, de desarrollo social, de seguridad pública y del sector energético, entre otros.

La coordinación intergubernamental de los tres órdenes de gobierno es una estrategia fundamental para el fortalecimiento de los Municipios por ello la FENAMM mantiene una relación estrecha y colaboración con los gobiernos de los estados, con el objetivo de desarrollar agendas municipalistas estatales y regionales. Con esta alianza se favorece y refuerza el vínculo del Gobierno estatal con los Gobiernos municipales.

Las organizaciones mundiales de gobiernos locales establecen la visión global del rumbo de los gobiernos locales, la FENAMM sostiene una fuerte relación con éstas para promover el intercambio de experiencias exitosas en el ámbito internacional que refuercen la acción de los Municipios mexicanos, y conocer las líneas estratégicas generales del ámbito local. La FENAMM forma parte de este fuerte movimiento asociacionista mundial.

FENAMM busca siempre hacer llegar a los Municipios de México diversas alternativas para el financiamiento de proyectos y la réplica de programas exitosos; por ello sostiene una sólida relación con diversas Agencias e Instancias de Cooperación tanto nacionales como internacionales. Busca así la asistencia técnica, la reducción de pobreza, la protección ambiental y urbano-industrial en los Municipios mexicanos. De igual forma estas agencias desarrollan estudios con indicadores de progreso que son de gran utilidad para los gobiernos municipales.